Do danas je na ovom fakultetu diplomiralo više od 6500 stomatologa.

Od 2017. na fakultet je uvedena cjelovita nastava na engleskom jeziku.

Za početak povijesti visokoškolske stomatološke izobrazbe u Hrvatskoj uzima se dodjela odobrenje za poučavanje iz područja stomatologije i zubarstva Eduardu Radoševiću koji je 1909. završio Medicinski fakultet u Beču, a stomatologiju specijalizirao 1910. u Berlinu.

Radošević je 1922. godine utemeljio Katedru za odontologiju, a poslije i Stomatološku kliniku na Medicinskom fakultetu.

Zaseban cjelovit studij stomatologije u Hrvatskoj postoji na Medicinskome fakultetu od 1948, osnivanjem Odontološkog odsjeka.

Godine 1962. studij je odvojen od Medicinskog fakulteta i osnovan Stomatološki fakultet Sveučilišta u Zagrebu.